粪便留取量对粪便中细菌结构和功能的影响

杨成聪; 尤利军; 吕瑞瑞; 靳昊; 赵志鑫; 孙志宏

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粪便留取量对粪便中细菌结构和功能的影响

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目的探究不同粪便留取量对肠道菌群构成研究结果的影响，为肠道菌群构成研究中粪便样本的采集方式提供参考。方法本研究分别对全便和部分粪便进行预处理，并使用PacBio SMRT测序技术对10名志愿者的20份粪便样本进行了16S rRNA全长测序，通过多元统计学等手段对粪便中细菌的构成、多样性和功能进行比较分析。结果 Eubacterium rectale、Eubacterium ventriosum和Allisonella histaminiformans等低丰度物种的相对丰度在不同粪便留取量中有一定差异，其在全便中的相对丰度均显著高于部分粪便（P＜0.05）。但Wilcoxon配对检验发现粪便留取量对肠道菌群结构、多样性和功能的影响均无显著性差异（P＞0.05）。不同个体间肠道菌群结构存在明显差异，且粪便留取量的影响远小于个体差异。结论全便和部分粪便两种粪便留取量对检测微生物的组成、多样性和功能无显著影响，因此取部分粪便即可满足对肠道菌群研究的要求。

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来源
《中国微生态学杂志》 |2022年第6期|651-656|共6页
作者
杨成聪; 尤利军; 吕瑞瑞; 靳昊; 赵志鑫; 孙志宏;
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作者单位

内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室内蒙古乳品生物技术与工程重点实验室;

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正文语种 chi
中图分类微生物学检验;
关键词
肠道菌群; PacBio SMRT; 菌群构成; 菌群功能;

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