盐城地区柯萨奇病毒A组16型分离株VP1区基因分子生物信息学分析

姚学君; 李峰; 陈国清; 张红军; 姜仁杰; 管书慧; 徐士林; 刘秀兰; 沈进进

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目的分析盐城地区柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16,CVA16）VP1区蛋白结构和B细胞表位。方法基于盐城地区2017年CVA16分离株J837 VP1区蛋白序列,采用分子生物信息学软件预测蛋白质理化特性、亲水性、二级结构和抗原表位等。结果盐城地区CVA16分离株VP1区编码蛋白为亲水蛋白,无信号肽,有1个跨膜螺旋区域,二级结构以无规则卷曲为主,存在7个潜在的B细胞抗原表位。结论本文成功预测了CVA16分离株VP1区蛋白二级结构和B细胞优势表位,为CVA16疫苗研研发提供了科学依据。

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来源
《现代预防医学》 |2019年第21期|3997-40004020|共4页
作者
姚学君; 李峰; 陈国清; 张红军; 姜仁杰; 管书慧; 徐士林; 刘秀兰; 沈进进;
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作者单位

盐城市疾病预防控制中心;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类人体病毒学（致病病毒）;
关键词
柯萨奇病毒A组16型; VP1区; 生物信息学; 预测;

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