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基于宏基因组学分析的健康献血人群潜在病原体分类与检测

         
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目的了解凉山州健康无偿献血人群血液微生物组信息,检测血液中可能存在的病原体,并调查其流行情况。方法随机采集凉山州健康献血人群血液标本1299(人)份,提取总核酸后进行高通量测序,通过宏基因组学分析,确定微生物组。采用实时荧光定量PCR和酶联免疫吸附试验分别检测单份血清标本的HSV DNA和HSV抗体,对比分析不同性别、年龄、职业及受教育程度等献血者HSV阳性率。结果通过高通量测序,DNA pool获得数据3.49 GB,去除人类DNA背景后,结果注释为细菌、寄生虫/真菌和病毒的DNA序列片段分别是213057reads,10623reads,15reads;cDNA pool获得数据2.79 GB,去除人类DNA背景后,结果注释为细菌、寄生虫/真菌和病毒的片段分别是4105600reads,18446reads和0reads。HSV-1和HSV-2血清总抗体阳性率为8.62%(112/1299)和18.32%(238/1299),HSV DNA阳性率0.77‰(1/1299)。结论本研究结果证实了凉山州健康献血人群血液中的微生物组信息,并鉴定了其中的新发再发病原体。凉山州HSV感染具有区域特异性。鉴于HSV-2和HIV感染的协同相关性,考虑率先在凉山州以及其他HIV高流行区的不同人群中开展HSV-2流行病学调查,以期服务于HIV感染防控工作。

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