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肾综合征出血热病毒Gou3株M片段的分子特性及序列的比较分析

         

摘要

为测定我国肾综合征出血热病毒 Gou3 株的 M 片段全基因序列,了解该株分子基础,并分析其与其他病毒株的差异,将提取的感染了病毒的 Vero - E6 细胞总 R N A 进行逆转录 P C R扩增,产物直接或纯化后克隆于 T 载体并测定序列,结果测得 Gou3 株 M 片段的全基因序列共3 651 个核苷酸,最大读码框架从47 到3 448 ,共编码1 134 个氨基酸。四种核苷酸的比例分别为 A3069 % , T 3001 % , G2155 % , C1775 % , G C 含量为3930 % , A T 含量为6070 % 。应用不同的载体系统、不同的转化用菌种、从不同的传代株中扩增,确证了测序结果的正确性。序列同源比较分析表明: Gou3 株与 H T N 型同源性为705 % ~715 % ,与 S E O 型为839 % ~845 % ;其氨基酸序列与 H T N 型同源性为765 % ~773 % ,与 S E O 型为932 % ~973 % 。核苷酸序列及其系统发生树分析表明: S E O 型的毒株间 M 片段全基因序列同源性较高为947 % ~995 % ,而 Gou3 株与 S E O 型毒株间差异高达154 % ~161 % , G2

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