羊栖菜硫酸多糖诱导下的人红白血病HEL细胞差异表达基因分析

丁浩淼; 杜昊霏; 付瑞洁; 金旭东; 谢策; 陈彤妮; 汪财生; 钱国英

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为探讨人红白血病HEL细胞经羊栖菜硫酸多糖(SFPSⅡ)处理后基因表达谱的变化,本研究用SFPSⅡ作用HEL细胞24 h,应用转录组技术筛选差异表达基因,分析差异基因富集的GO功能和KEGG信号通路,并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)对部分差异表达基因进行验证。结果表明,SFPSⅡ处理HEL细胞后,HEL细胞活力降低,呈浓度依赖性,但对正常人胚肺成纤维细胞MRC-5几乎无毒性。与对照组相比,共有1248个基因差异表达,其中219个上调,1029个下调。GO分析显示,差异表达基因主要改变DNA构象、硫酸盐转运及对肿瘤坏死因子和外在凋亡信号反应等生物学功能。KEGG信号通路分析显示,显著富集的通路与Rap 1信号通路等癌症和免疫密切相关。试验随机选择16个显著差异基因,并通过RT-qPCR进行确认,发现SFPSⅡ诱导HEL细胞后,导致表达差异基因与肿瘤生物学进程和通路显著相关。本研究结果为揭示羊栖菜硫酸多糖抗肿瘤机制的提供了理论依据。

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来源
《核农学报》 |2021年第3期|595-604|共10页
作者
丁浩淼; 杜昊霏; 付瑞洁; 金旭东; 谢策; 陈彤妮; 汪财生; 钱国英;
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作者单位

浙江万里学院生物与环境学院;

浙江宁波315100;

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正文语种 chi
中图分类肿瘤学;
关键词
羊栖菜; 硫酸多糖; 人红白血病; 转录组; 差异表达基因;

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