新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因序列分析

蒋盛军; 纪绍忠; 唐青; 杨红彦; 崔晓英; 毕烨; 阚飙; 高守一

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利用一种改良的非依赖核酸序列的单引物扩增方法,从新成人腹泻轮状病毒J19株的核酸中扩增基因,克隆至pMD18-T中并进行测序和基因序列分析。J19株的VP2、VP3的编码基因为基因2、4,分别长2 969bp、2 204bp,它们分别编码973个氨基酸和719个氨基酸。J19株的VP2蛋白序列对B组人轮状病毒IDIR株的一致性为47.2%;J19株的VP3蛋白序列对C组人轮状病毒Cowden株一致性为25.1%。对J19株VP2的遗传进化分析表明,J19株在进化树上的位置靠近外群蛋白以及A、B和C组轮状病毒分枝的根部,并且它比较偏向于B组轮状病毒的分枝。这与VP6的遗传进化分析结果相一致。根据上述结果推测J19株可能是一个与B组轮状病毒的起源和进化密切相关的毒株之一;同时,这表明VP2在研究轮状病毒的遗传进化上具有重要价值。关于新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因的序列分析,这是首次报道。

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来源
《病毒学报》 |2006年第3期|172-175|共4页
作者
蒋盛军; 纪绍忠; 唐青; 杨红彦; 崔晓英; 毕烨; 阚飙; 高守一;
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作者单位

中国疾病预防控制中心传染病预防控制所;

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正文语种 chi
中图分类肠道病毒与肝炎病毒;
关键词
新成人腹泻轮状病毒; J19株; 基因; 克隆; 序列分析;

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