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北京地区人偏肺病毒膜表面糖蛋白G编码基因和特征的分析

         
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为了解北京地区人偏肺病毒（hMPV）膜表面糖蛋白G编码基因的特征，提取2003年和2004年各6份hMPV阳性的临床呼吸道标本中的RNA，经用随机引物合成cDNA后，用特异性引物扩增G蛋白全基因，克隆至pBST载体中并进行测序。用生物软件与GenBank中hMPV的基因序列进行比较和种系进化分析。12株hMPV可以分为两个主要的进化簇1和2。每个进化簇还可以再分为不同的亚进化簇。3株（2003年）hMPV属于进化簇1；9株（3株2003年和6株2004年）hMPV属于进化簇2。这12株hMPV G蛋白基因的核苷酸长度在624～711nt，使用了两种不同的终止密码，编码的氨基酸长度为208～236aa，蛋白质分子量为22．9～25．8kD。与进化簇2相比，进化簇1的3株hMPV都出现了3个核苷酸的缺失，但未改变读码框架。同一进化簇内的hMPV G蛋白基因核苷酸和氨基酸的同源性分别为95．7％～100％和91．8％～100％，不同进化簇间的核苷酸和氨基酸的同源性分别为56．3％～57．4％和34．3％～38．2％。疏水性分析表明这12株hMPV G蛋白是典型的Ⅱ型跨膜锚定蛋白，分别与两个进化簇代表株的疏水图一致。这些hMPV的G蛋白氨基酸的替换集中在胞外区。它们都含有高百分比的脯氨酸（P）、丝氨酸（S）和苏氨酸（T），含有相当数量的位于胞外区的O-连接糖基化化点。这些hMPV的G蛋白的N连接糖基化位点数目和位置不尽相同。通过对G蛋白基因的分析显示，2003年和2004年北京地区流行的hMPV分属于两种不同的进化簇。基因分析品示hMPV的G蛋白是高精基化的膜表面蛋白，具有与同属于副粘病毒科、肺病毒亚科的人呼吸道合胞病毒（hRSV）的G蛋白相似的基因特征，推测其功能和在感染免疫中的作用相当于hRSV的G蛋白，但有待进一步深入研究予以证实。

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