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小双节RNA病毒中国株基因组第二节段的序列测定及分析

         

摘要

:1997年从河北省一起成人腹泻暴发病人粪便中首次分离到小双节RNA病毒 (picobirnavirus,PBV)中国株。为研究该病毒复制必需的依赖RNA的RNA多聚酶 (RdRp)活性机理 ,采用改进的单引物扩增法克隆和测序了病毒基因组第二节段。结果表明 :第二节段全长 16 96个核苷酸 ,只有一个ORF ,占全长的 93 9% ,编码 5 30个氨基酸残基的蛋白 ,5′ NTRAT丰富 (75 4% ) ,可能是本位调控元件区。编码蛋白的氨基酸序列有其它RNA病毒RdRp保守区普遍存在的基序 ,提示PBV第二基因编码蛋白为RdRp。

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