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新城疫病毒V4株主要基因的克隆与序列分析

         

摘要

设计4对引物,利用RT—PCR技术分别扩增出新城疫病毒(NDV)V4株长约4.2、4.1、4.1、3.5kb的4个互相重叠的核苷酸片段,并分别进行了克隆和序列测定。将这4个片段的核苷酸序列拼接后,得到长为15 061 bp的核苷酸序列。该序列包含有NDVv4株结构基因NP的全部编码区和5’端非编码序列,结构基因P、M、F、HN及L基因的全部编码区和非编码区序列,各结构基因之间的间隔序列以及基因组5’端部分尾巴序列(108bp)。序列比较分析表明,NDVv4株F蛋白裂解位点序列为^112GKQGRL^117,HN基因编码616个氨基酸,符合无毒株的特征;NDVv4株同基因组长度为15 192 bp的毒株一样,在基因组的1647~1648bp间比基因组长为15192bp的毒株少了6个碱基。

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