球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对性质的研究

陈进; 李靖; 章林溪; 姜舟婷; 夏阿根; 叶高翔; 赵得禄

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球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对性质的研究

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采用CSU软件 (Contactsofstructuralunits) ,对 61种球状蛋白质分子中氨基酸紧密接触对 (Residue residuecontact)进行了研究 .重点研究了不同氨基酸在形成远程紧密接触对 (Long rangecontact)和近程紧密接触对 (Short rangecontact)时的不同能力 .发现氨基酸Leu,Val,Ile,Met,Phe,Tyr,Cys,Trp(疏性氨基酸 ,H)比较容易形成远程紧密接触对 ,氨基酸Glu,Gln ,Asp ,Asn,Lys,Ser,Arg,Pro(亲水氨基酸 ,P)比较难形成远程紧密接触对 ,而氨基酸Ala,Gly,Thr,His(中性氨基酸 ,N)在形成远程紧密接触对时能力一般 .它们平均每个氨基酸可形成 6 0 3 ,3 64和 4 43个远程紧密接触对 .同时它们在形成近程紧密接触对时能力非常接近 ,平均每个氨基酸可形成的近程紧密接触对数目在 2 3 4～ 2 85变化 ,差别非常小 .亲水氨基酸 (P) ,中性氨基酸 (N)和疏水性氨基酸 (H)

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来源
《高分子学报》 |2003年第2期|171-174|共4页
作者
陈进; 李靖; 章林溪; 姜舟婷; 夏阿根; 叶高翔; 赵得禄;
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作者单位

浙江大学物理系;

中国科学院化学研究所分子科学中心;

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正文语种 chi
中图分类氨基酸;
关键词
球状蛋白质; 氨基酸; 紧密接触对; CSU软件; 折叠; 结构; 稳定性;

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