我国首次分离的辛德毕斯病毒(XJ-160病毒株)全基因组核苷酸序列测定

李蕾; 梁国栋; 周国林; 李富胜; 付士红; 何海怀; 金奇; 侯云德

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对我国首次分离的辛德毕斯病毒XJ 16 0病毒株全基因组核苷酸序列进行测定 ,阐明该病毒基因组与国外株的差异 ,了解其分子致病机理。测序结果显示 ,XJ 16 0病毒全基因组除 5′末端帽子结构和 3′末端多聚腺苷酸尾外共 116 2 6个核苷酸 ,编码 3731个氨基酸。非结构基因的编码区长 746 4核苷酸 (6 0nt～ 75 2 3nt) ,编码 2 486氨基酸 ,翻译成四种非结构蛋白 (nonstructuralprotein ,nsp1 4)。结构基因长 3738核苷酸 (75 6 8～ 1130 6 ) ,编码 12 45个氨基酸 ,翻译成三种结构蛋白和两个小分子肽 (capsid ,E1- 3、6k)。病毒基因组 5′末端和 3′末端及结构基因和非结构基因之间分别有 5 9个核苷酸、45个核苷酸和 32 3个核苷酸的非编码区。核苷酸序列分析表明 ,XJ 16 0病毒具备典型的甲病毒属辛德毕斯病毒基因组特征 ,与标准辛德毕斯病毒AR339病毒株相比 ,核苷酸序列存在 18%差异 ,氨基酸差异为 8%。这是我国完成的第一株辛德毕斯病毒全基因组序列测定 ,序列已输入国际基因库 (GenBankAF10 372 8)。

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来源
《病毒学报》 |2000年第2期|102-105|共4页
作者
李蕾; 梁国栋; 周国林; 李富胜; 付士红; 何海怀; 金奇; 侯云德;
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作者单位

中国预防医学科学院病毒学研究所病毒基因工程国家重点实验室;

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正文语种 chi
中图分类节肢动物传播的病毒（虫媒病毒）;分子遗传学;
关键词
辛德毕期病毒; 甲病毒; 基因组; 核苷酸序列;

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