基于FPGA的分子动力学模拟系统设计

郭禾; 龙珠; 王宇新; 苏丽丽

首页> 中文期刊> 《微电子学与计算机》 >基于FPGA的分子动力学模拟系统设计

基于FPGA的分子动力学模拟系统设计

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

FPGA加速分子动力学模拟在材料科学、分子科学等方面应用广泛,一直是高性能计算领域的热门话题之一.在分子动力学模拟中,分子间作用力(LJ力)的计算是整个过程耗时最长的部分,文中设计的系统将其放在FP-GA上完成,其余部分由CPU完成.根据LJ力的特点,FPGA加速的计算采用以下方法进行设计:利用邻近粒子搜索算法-元胞列表算法选取粒子对,并使用过滤模块进一步减少计算量;计算LJ力时采用先离散后插值的方法计算公式中的高次幂同时避免了开方运算.所有部件组成流水线结构,进一步提高整体的性能.

著录项

来源
《微电子学与计算机》 |2009年第8期|246-248|共3页
作者
郭禾; 龙珠; 王宇新; 苏丽丽;
展开▼
作者单位

大连理工大学计算机科学与技术系;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类总体结构、系统结构;
关键词
FPGA; 分子动力学; LJ力; 元胞列表算法;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于分子对接的thanatin与NDM-1分子动力学模拟研究 [J] . 史祥睿 ,代宇婕 ,张弢 . 化学通报（印刷版） . 2021,第011期
2. 基于分子动力学模拟的CH4溶解对原油分子间作用的影响机制研究 [J] . 李秉繁 ,刘刚 ,陈雷 . 化工学报 . 2021,第003期
3. 基于蒙特卡洛分子动力学模拟的算法在天然产物小分子与蛋白质相互作用中的应用 [J] . 曹茂启 ,王珏 ,罗骏 . 广东化工 . 2019,第020期
4. 基于中子散射、氘化技术和分子模拟探究蛋白质及及其表面水分子的动力学行为（英文） [J] . 叶毅扬 ,洪亮 . 物理学进展 . 2019,第3期
5. 基于分子动力学模拟的胶原分子力学特性研究 [J] . 葛海斌 ,张春秋 . 医疗卫生装备 . 2018,第003期
6. 基于FPGA的分子动力学模拟系统设计 [C] . 郭禾 ,龙珠 ,王宇新 . 2009年全国开放式分布与并行计算学术年会 . 2009
7. 基于增强采样分子动力学模拟的蛋白质和小分子相互作用热力学和动力学研究 [A] . 牛余珍 . 2017

基于FPGA的分子动力学模拟系统设计

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅