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萝卜中一种新dsRNA的全长cDNA克隆及序列分析

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从‘一点红’萝卜（Raphanus sativus-root‘Yidianhong’）叶片中提取dsRNA，应用SPAT方法对各dsRNA条带进行cDNA克隆并测序，除获得先前报道的5条序列（RasR1～RasR5）以外，还得到一条新的全长序列，将其定名为RasR6（EU285027）。序列分析结果表明：RasR6全长为1778bp，其正义链编码1个由502个氨基酸组成、分子量约为55．1kD的蛋白质。该序列与前人报道的双分病毒科5个病毒序列具有相似性，且它们均编码双分病毒科病毒的外壳蛋白（eapsidprotein，CP）。核苷酸序列比对结果显示：RasR6与同时来源于萝b的RasR1和RasR2的5′UTR序列高度同源，且其3′末端具有polyA结构，而与RasR3、RasR4和RasR5的UTR则没有明显的相似性。因此，推测RasR6与RasR1、RasR2同属于双分病毒RasV1（Raphanus sativus virus 1），可能与RasR2共同编码该病毒的CP或作为RasV1的卫星RNA存在。

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来源
《园艺学报》 |2008年第8期|1209-1214|共6页
作者
李露露; 李力强; 乔爱民; 陈亮; 陈集双;
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作者单位

浙江理工大学生物工程研究所;

杭州310018;

仲恺农业技术学院农业与园林学院;

广州510225;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类萝卜;
关键词
萝卜; 双链RNA; 双分病毒科; Raphanus; sativus; virus; 1;

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