陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证

王琴琴; 陈修贵; 陆许可; 王帅; 张悦新; 范亚朋; 陈全家; 叶武威

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为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花。结果表明,GhPKE1基因序列全长1048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56。分别用硫酸钠(Na_(2)SO_(4))和氯化镉(CdCl_(2))胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异。qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na_(2)SO_(4)和抗CdCl_(2)性显著减弱。综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础。

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来源
《中国农业科技导报》 |2022年第1期|38-45|共8页
作者
王琴琴; 陈修贵; 陆许可; 王帅; 张悦新; 范亚朋; 陈全家; 叶武威;
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作者单位

新疆农业大学农学院;

中国农业科学院棉花研究所;

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正文语种 chi
中图分类棉;
关键词
陆地棉; GhPKE1; 生物信息学分析; VIGS;

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