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斯氏弓形杆菌基于基因组序列遗传特征分析

         

摘要

目的 获得斯氏弓形杆菌的遗传特征,并对其耐药基因及毒力相关基因进行预测分析.方法 对本实验室分离培养的8株斯氏弓形杆菌进行基因组测序并从NCBI和PATRIC数据库中下载全部已完成基因组测序的15株斯氏弓形杆菌的全基因组序列,应用生物信息学软件对23株不同地域、不同宿主来源的斯氏弓形杆菌进行遗传特征分析.结果 23株斯氏弓形杆菌中仅3株菌携带耐药基因,且均为p-内酰胺类抗生素耐药基因.所有菌株均含有与免疫逃避、侵袭及运动等相关的毒力基因.与其他菌种弓形杆菌常见的10种毒力基因比对分析发现,本研究中所有斯氏弓形杆菌菌株均含有ciaB、tlyA、cj1349、pldA和mviN基因,2株菌(CNAS12-1和F28)含有iroE基因,均不携带另外4种毒力基因.21.7%(5/23)的菌株包含Ⅵ型分泌系统(T6SS)基因簇,且其与弯曲菌属内的T6SS存在基因组成及排列的差异.结论 斯氏弓形杆菌有较高的遗传多样性,部分菌株可能有潜在的耐药和致病特征.

著录项

  • 来源
    《疾病监测》 |2021年第1期|37-41|共5页
  • 作者单位

    中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京102206;

    中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京102206;

    北京市顺义区疾病预防控制中心 北京101300;

    中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京102206;

    北京市顺义区疾病预防控制中心 北京101300;

    深圳市南山区疾病预防控制中心 广东深圳518054;

    中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京102206;

    中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京102206;

    中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 传染病预防控制国家重点实验室 北京102206;

    深圳市南山区疾病预防控制中心 广东深圳518054;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 预防、卫生;肠道杆菌;
  • 关键词

    斯氏弓形杆菌; 耐药基因; 毒力基因; Ⅵ型分泌系统; 种群结构特征;

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