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基于ITS序列构建系统发育树鉴定市售黄芪饮片基源的研究

         

摘要

cqvip:目的:建立一种基于内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列的系统发育树方法,快速、准确地鉴别市售黄芪饮片的基源。方法:提取经鉴别的不同来源的14份蒙古黄芪药材和8份膜荚黄芪药材的DNA,设计并合成ITS通用引物,经扩增和测序后采用MEGA 6.0软件将测序结果用邻接法构建系统发育树;收集市场上销售的16份黄芪饮片,采用设计的引物进行扩增后电泳并测序,按照邻接法构建系统发育树对其种类进行区分鉴定。结果:蒙古黄芪和膜荚黄芪ITS序列同源性极高,在整个ITS全序列区域仅第128位碱基上有G/A突变、第619位碱基上有G/-/T/C突变、第620位碱基上有T/C突变、第621位碱基上有C/A突变、第622位碱基上有A/-/C突变以及第623位碱基上有C/A/-突变;通过基因测序结果所建立的系统发育树,可以区分22份黄芪样品中膜荚黄芪和蒙古黄芪的遗传进化关系;对16份市售黄芪饮片的基源进行鉴别,其中12份为蒙古黄芪,4份为膜荚黄芪。结论:基于ITS序列构建的系统发育树,可有助于蒙古黄芪和膜荚黄芪药材或饮片的基源鉴别。

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