盐藻钙调素基因的克隆及表达分析

王明芳; 高相楠; 徐微微; 丛玉婷; 柴晓杰

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盐藻钙调素基因的克隆及表达分析

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为探究盐藻钙调素基因的结构与功能,利用RT-PCR和RACE技术克隆到盐藻钙调素基因(DsCaM,GenBank登录号:MN428415),并对其进行生物信息学分析,通过qRT-PCR方法检测盐藻钙调素在盐胁迫条件下的表达情况.试验结果显示,盐藻钙调素基因cDNA全长1061 bp,开放阅读框495 bp,编码164个氨基酸.盐藻钙调素为亲水蛋白,该蛋白主要分布在细胞质和液泡内,无跨膜区域,不存在信号肽,蛋白质的二级结构以α-螺旋(56.71％)和无规则卷曲(26.22％)为主,成功构建蛋白质三级结构.系统进化分析表明,盐藻钙调素基因与莱茵衣藻钙调素基因亲缘关系最近.qRT-PCR结果表明,在高盐胁迫下盐藻钙调素基因的表达量显著上调,胁迫6h时表达量达到最高值,差异达到极显著水平(P<0.01).该研究成果将为进一步分析盐藻钙调素基因的功能及盐藻应答盐胁迫信号的分子途径提供新信息.

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来源
《水产科学》 |2021年第3期|409-415|共7页
作者
王明芳; 高相楠; 徐微微; 丛玉婷; 柴晓杰;
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作者单位

大连海洋大学辽宁省省级高校水生生物学重点实验室辽宁大连 116023;

大连海洋大学辽宁省省级高校水生生物学重点实验室辽宁大连 116023;

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大连海洋大学辽宁省省级高校水生生物学重点实验室辽宁大连 116023;

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正文语种 chi
中图分类水产植物学;
关键词
盐藻; 钙调素; qRT-PCR; 生物信息学分析;

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