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m6A相关lncRNA预测肺鳞癌患者预后和免疫反应分析

         
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目的:旨于构建m6A相关lncRNA的肺鳞状细胞癌(LUSC)预后特征,并区分潜在的LUSC患者受益于免疫治疗。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载RNA-seq和临床信息数据,提取30个m6A调控因子和LncRNAs表达数据,通过Pearson相关分析获得m6A相关的LncRNAs。使用单因素Cox回归分析和Lasso回归分析,对m6A相关的预后lncRNA进行筛选,构建基于风险评分的模型,通过分层分析、单因素和多因素Cox分析进行验证。采用基因集合富集分析(GSEA)观察风险组的功能。采用CIBERSORT分析肿瘤浸润性免疫细胞(TICs),采用肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)预测免疫反应。结果:通过使用Lasso回归分析过滤的7个m6A相关lncRNAs建立预后特征。Kaplan-Meier生存分析显示,高危组总生存率低于低危组。独立预后分析显示,m6A相关lncRNA是LUSC的独立预后因素。在高低风险组之间存在不同的浸润性免疫细胞和信号通路。高危组的TIDE评分高于低危组,肿瘤突变负担较低,说明高危组可能对免疫治疗的反应较差。结论:在本研究中建立的m6A相关lncRNA的预后特征可作为预测LUSC患者预后的独立预后因子。

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