菠菜SpNHX1基因的克隆及生物信息学分析

张海洋; 付娆; 李茹霞; 顾寅钰; 梁晓艳; 宋延静; 李萌; 王向誉; 郭洪恩

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cqvip:从菠菜(Spinacia oleracea L.)栽培种中克隆得到1个NHX1基因,命名为SpNHX1。利用生物信息学软件对获得的基因核苷酸序列及编码的蛋白质序列进行分析,结果发现SpNHX1属于Vac亚家族,序列长度为6090 bp,开放阅读框为1662 bp,编码553个氨基酸残基。利用相关软件或在线工具对SpNHX1进行生物信息学分析,结果表明其编码蛋白分子式为C2818H4363N697O772S25,属于稳定的疏水性蛋白;进化树分析表明SpNHX1蛋白与拟南芥AtNHX1、AtNHX2亲缘关系较近,属于定位在液泡膜上的蛋白,SpNHX1蛋白与双子叶植物的NHX蛋白亲缘关系较近。

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来源
《湖北农业科学》 |2019年第23期|211-214|共4页
作者
张海洋; 付娆; 李茹霞; 顾寅钰; 梁晓艳; 宋延静; 李萌; 王向誉; 郭洪恩;
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作者单位

山东省蚕业研究所山东烟台 264002;

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正文语种 chi
中图分类菠菜;
关键词
菠菜(Spinacia oleracea L.); 耐盐; SpNHX1; 基因克隆; 生物信息学分析;

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