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系统发生网络构建算法综述

         

摘要

物种的进化史通常被描述成一棵有根系统树,但是当物种进化过程中发生网状进化事件(如,杂交、重组和水平基因转移)时,物种的进化史不再适合被描述成系统树.系统发生网络是系统树的一般化,也是被用来描述物种的进化史,并可以描述物种的网状进化事件.而且系统发生网络也可以可视化冲突数据集,如由不同的基因得到的物种树.因此,系统发生网络的研究是生物信息的一个重要领域.介绍了系统发生网络的概念、发展、研究现状,总结了现有的系统发生网络构建算法.

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