甘蓝型油菜响应干旱胁迫的转录组分析

张蕾; 阮羽萱; 潘娇; 陈敏; 刘博宇; 阮颖; 黄勇

首页> 中文期刊> 《江苏农业科学》 >甘蓝型油菜响应干旱胁迫的转录组分析

甘蓝型油菜响应干旱胁迫的转录组分析

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国主要油料作物之一,为国家粮油安全提供了重要保障。干旱严重限制了油菜种植规模扩大、产量与品质提升。为挖掘甘蓝型油菜抗旱的关键基因,阐明油菜耐旱机制,本研究以甘蓝型油菜湘油15为对象,通过实验室模拟干旱处理后的叶片为材料进行转录组测序(RNA-Seq)、生物信息分析并qRT-PCR验证。发现转录组样本平均Clean baseas约为9.6 G,且各样品碱基百分比(Q30)大于93.21%,比对到参考基因组上的Reads在89%以上。干旱处理4 h后,湘油15出现了440个差异表达基因(DEGs),其中148个基因上调,292个基因下调。随机选取10个基因(上调与下调各5个)进行qRT-PCR验证,其中9个基因的qRT-PCR结果与RNA-Seq结果相符,仅1个基因表达趋势相反,相似度可达90%,证实转录组测序结果的可靠性。结果表明甘蓝型油菜湘油15主要通过光合作用、碳代谢和渗透调节等途径调节抗旱能力,为进一步阐明油菜耐旱机制奠定了基础。

著录项

来源
《江苏农业科学》 |2023年第5期|51-55|共5页
作者
张蕾; 阮羽萱; 潘娇; 陈敏; 刘博宇; 阮颖; 黄勇;
展开▼
作者单位

湖南农业大学生物科学技术学院/湖南省作物表观遗传与发育重点实验室;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 S634.301;
关键词
甘蓝型油菜; 干旱胁迫; 转录组分析; 差异表达基因;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 不同桑树品种响应干旱胁迫的比较转录组学分析 [J] . 曾睿 ,任迎虹 ,祁伟亮 . 南方农业学报 . 2022,第3期
2. 烤烟品系LY1306在PEG干旱胁迫下的生理响应及转录组学分析 [J] . 周炎 ,丁松爽 ,赵莉 . 中国烟草学报 . 2017,第6期
3. 基于转录组学比较研究甜高粱幼苗响应干旱和盐胁迫的生理特征 [J] . 王志恒 ,魏玉清 ,赵延蓉 . 草业学报 . 2022,第3期
4. 甘蓝型油菜BnNAC转录因子鉴定与非生物胁迫响应分析 [J] . 王勇锋 ,杨翠玲 ,冷秋丽 . 中国油料作物学报 . 2020,第4期
5. 中国辣椒热胁迫转录因子的全基因组鉴定及热胁迫响应的初步分析 [J] . 高崇伦 ,黄家权 ,成善汉 . 植物科学学报 . 2020,第002期
6. 马铃薯不同根长基因型品种在干旱胁迫下的比较转录组分析 [C] . 秦天元 ,许德蓉 ,王一好 . 2021年中国马铃薯大会 . 2021
7. 甘蓝型油菜响应低温胁迫的转录组与代谢组学分析 [A] . Ali Raza . 2021

甘蓝型油菜响应干旱胁迫的转录组分析

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅