高温胁迫下2个棉花品种转录组可变剪切差异分析

丁宇; 王马寅; 唐敏强; 李子阳; 谢尚潜

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高温胁迫下2个棉花品种转录组可变剪切差异分析

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棉花(Gossypium hirsutum L.)是一种重要的经济作物,是世界上第二大的天然纺织纤维来源和重要的食用油来源。棉花对生物和非生物胁迫高度敏感,尤其是高温胁迫极易影响花粉的活力和花药的开裂。为了解析棉花在高温胁迫下基因转录水平的相应变化机制,开展了热敏和耐热2个棉花品种的全长转录组响应高温胁迫处理变化的研究。通过转录本的可变剪切分析发现,2个棉花品种在高温胁迫下可变剪切的总数显著增加。热敏品种Che61-72中发现了2900个差异表达基因,并且差异基因在加热前样本(R0)和加热12 h后的样本(R12)中分别识别到了13251个和25296个可变剪切事件,其中内含子保留事件增加得最多,有3837个。耐热品种新陆早36号中发现了2437个差异表达基因,在加热前样本(T0)和加热12 h后的样本(T12)中鉴定到了11248个和13769个可变剪切事件,外显子跳跃事件变化得最大,增加了4144个。富集分析发现,2个品种的差异基因都显著富集到了光系统Ⅰ的光捕获、叶绿体类囊体膜和光合作用-天线蛋白通路中,并筛选出5个关键基因(CPB3、A0A1U8IZF2、A0A1U8KCA2、A0A1U8NDW4和A0A1U8NI70),均被注释为叶绿素a/b结合蛋白,它们参与了调控棉花光合作用动态平衡。本研究为棉花在高温胁迫的调节机制的深入研究提供了理论依据,为后续耐高温的种质改良及新品种培育提供了数据支持。

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来源
《江苏农业科学》 |2023年第5期|1-11|共11页
作者
丁宇; 王马寅; 唐敏强; 李子阳; 谢尚潜;
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作者单位

海南大学;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 S562.01;
关键词
棉花; 高温胁迫; 全长转录组; 纳米孔测序; 可变剪切;

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