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有机种植与常规种植蔬菜地土壤细菌群落多样性分析

         

摘要

为揭示有机种植和常规种植2种不同方式对不同土层(0~15 cm和15~30 cm)细菌群落的多样性特征,采用Illumina Miseq高通量测序技术比较了土壤细菌群落结构的差异,利用FAPROTAX软件对获得相应土层细菌群落的功能进行预测。共检测到8 792个OTU,分属于88门152纲319目446科841属371种。有机种植方式的优势菌门为放线菌门、绿弯菌门,而常规种植以变形菌门、酸杆菌门为优势菌门。属水平上,有机种植提高了Haliangium、Pelagibius和Castellaniella等有益菌的丰度;常规种植增加了促进氮磷循环和降解农药等有机污染物的细菌丰度,如Candidatus_Entotheonella、Candidatus_Nitrosotenuis、Flavisolibacter、Terrimonas、Sphingomonas、Pseudoxanthomonas,同时常规种植也使得土传病害致病菌Ralstonia的丰度增加;不同土层之间,优势菌属也表现出明显不同。α-多样性指数分析表明,有机种植0~15 cm土层细菌群落丰富度、物种的均匀度均为最高,且与其他土层在observed_species指数、Shannon指数、Simpson指数、Chao1指数、ACE指数有显著差别(P<0.05)。dbRDA分析显示,环境因子对土壤细菌群落的影响大小依次为总氮、土壤有机质、总磷、pH值和总钾。Mantel test检验表明,总氮、土壤有机质、总磷、pH值是影响不同种植方式土壤细菌群落的关键环境因子。上述结果表明,不同种植方式不同土层细菌多样性存在差异,各具优势菌群。有机种植细菌群落的多样性、丰富度和稳定度更高,更有利于增加土壤中的有益菌群。

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