油茶CYP78A10同源基因及其SSR位点

赵松子

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油茶CYP78A10同源基因及其SSR位点

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拟南芥(Arabidopsis thaliana)CYP78A亚基因家族基因参与种子大小的遗传控制.对普通油茶(Camellia oleifera)转录组数据进行挖掘,从花蕾和根转录组数据中分别得到1条CYP78A10的同源基因,再从油茶基因组三代测序数据中鉴别出其基因组DNA序列,最后,得到2条油茶CYP78A10同源基因全长CDS序列,分别命名为CoCYP78A10a、CoCYP78A10b.用植物CYP78A亚基因家族基因的蛋白质序列构建进化树,结果表明,CoCYP78A10a、CoCYP78A10b与CYP78A10、GmCYP78A10在一个分支,可能参与油茶种子大小的调控.通过SSR位点信息分析,在CoCYP78A10a第1外显子5'端非翻译区、CoCYP78A10b的启动子区分别发现1个适宜进行SSR分子标记开发的多态性位点.

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来源
《江西林业科技》 |2021年第2期|12-16|共5页
作者
赵松子;
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作者单位

江西省林业科学院·江西省油茶种质资源保护与利用实验室江西南昌 330013;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类油茶;分子遗传学;
关键词
普通油茶; CYP78A10; SSR; 种子大小; 同源基因;

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