烟草基因组一类微小倒置重复转座元件(MITE)目前仍具转座活性

骆红梅; 王菁菁; 马文广; 李婵媛; 李永平; 钟若涵; Jack Chen; 董海涛; 李文正

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微小倒置重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element,MITE)是真核基因组中含量丰富的一类非自主转座元件,且与许多重要生物学事件密切相关.目前为止,仅在极少数物种中鉴定出几个MITE家族仍具备活跃的转座活性,如此便无法充分地获知MITE转座的分子细节以解析其转座机制.本研究选择烟草(Nicotiana tabacum)基因组为研究对象,首先应用生物信息学方法分析完成了烟草MITE同源序列的种类和数量分布状况,包括MITE元件群的结构特征及相关信息;再者,通过检测MITE元件群在不同烟草品系中的多态性差异,获得其中一个元件(TMi 1)可能具有转座活性的初步证据;其后,在建立了二组适用于MITEs转座活性检测的生物学表型的基础上,采用转座子显示技术及后续验证实验,最终确认TMi 1元件于目前仍具有转座活性.这是烟草基因组中首次发现一个活跃转座的MITE,拓展了人们对具转座活性植物种类的认识范围,有助于充分认识和挖掘烟草基因组中丰富的转座子种类和资源,也为理解和定义基因组进化以及生物多样性形成的遗传规律提供有用线索.

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来源
《农业生物技术学报》|2015年第9期|1157-1166|共10页
作者
骆红梅; 王菁菁; 马文广; 李婵媛; 李永平; 钟若涵; Jack Chen; 董海涛; 李文正;
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作者单位

杭州师范大学生命与环境科学学院,杭州310036;

浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所,杭州310029;

云南省烟草农业科学研究院,昆明650021;

浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所,杭州310029;

云南省烟草农业科学研究院,昆明650021;

浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所,杭州310029;

美国国立卫生院生物信息部,马里兰州20892;

浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所,杭州310029;

云南省烟草农业科学研究院,昆明650021;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
微型反向重复转座元件(MITE); 烟草; 转座; 组织培养;
入库时间 2024-01-27 06:47:15

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