基于DIA LC-MS的高淀粉型与低淀粉型粉葛叶片的定量蛋白质组学差异

黄琦; 程建峰; 朱卫丰; 褚怀亮; 赵文峰; 葛菲; 吴波; 丁立军; 张建华; 余聪

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[目的]寻求粉葛生长发育的蛋白调控机制。[方法]以高淀粉型赣葛1号(鲜葛根含淀粉20%,干葛根含淀粉35%)和低淀粉型赣葛2号(鲜葛根含淀粉14%,干葛根含淀粉25%)为材料,采用基于全扫描数据非依赖性采集高分辨率色谱-质谱(DIA LC-MS)的定量蛋白质组学技术得到差异蛋白质,并对差异蛋白进行GO富集、KEGG通路和KOG分析。[结果]2个不同粉葛叶片中有178个蛋白(101个上调和77个下调)存在显著差异,主要涉及分子功能,但|log2(FC)|>5.0的差异蛋白仅占11.2%。GO富集分析表明,差异蛋白主要富集在代谢过程、催化活性、水解酶活性、细胞部分、细胞内部分、细胞质部分和细胞内细胞器类别。KEEG富集代谢途径集中在苯丙氨酸生物合成、植物体内的MAPK信号通路、次生代谢物生物合成、丙酮酸代谢和脂肪酸代谢。KOG分析显示,差异蛋白功能主要归为核苷酸转运和代谢、核糖体结构和生物发生、能量产生和转换、信号转导以及翻译后蛋白修饰、周转和伴侣机制。差异程度极大的蛋白依次为上调的类LHCⅡ型1叶绿素a-b结合蛋白、kunitz家族胰蛋白酶和蛋白酶抑制剂前体、凝集素类蛋白和几丁质酶同源物及下调的类溶酶体Pro-X羧肽酶、预测的类dCTP焦磷酸酶1、富含半胱氨酸的受体类蛋白激酶25和色氨酸转氨酶相关蛋白4。[结论]研究结果为粉葛的生长发育、营养成分和活性物质的合成及调控、遗传改良及分子育种等提供数据支撑和技术途径。

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来源
《安徽农业科学》 |2023年第14期|168-177|共10页
作者
黄琦; 程建峰; 朱卫丰; 褚怀亮; 赵文峰; 葛菲; 吴波; 丁立军; 张建华; 余聪;
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作者单位

江西绿色生态葛研究所;

江西农业大学农学院;

江西中医药大学药学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类中药化学;
关键词
粉葛; 高淀粉型; 低淀粉型; 定量蛋白组学; 差异蛋白; DIA LC-MS;

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