菠萝蜜EST-SSR标记开发及其种质资源遗传多样性分析

顾洪涛; 李映志; 叶春海; 陈亮

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菠萝蜜EST-SSR标记开发及其种质资源遗传多样性分析

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[目的]分析菠萝蜜EST-SSR标记的稳定性和多态性揭示能力,并将其用于菠萝蜜种质资源遗传多样性研究.[方法]利用已获得的菠萝蜜cDNA文库中的EST序列,通过搜索SSR序列,设计引物,PCR扩增后,银染检测扩增结果.[结果]设计开发出479对EST-SSR引物,其中399对能在菠萝蜜上扩增出产物,282对具有多态性,多态性扩增引物占58.87％;从中选择60对能够清晰扩增的多态性引物,对64份菠萝蜜种质资源进行遗传多样性分析,60对EST-SSR引物共扩增出188条带,不同引物的扩增条带数在2～11,平均3.13条;其中有168条为多态性条带,多态率为89.36％;每对引物的多态信息含量(PIC)为0.407 7～0.958 9,平均PIC为0.792 2,这说明供试材料具有较高的遗传多样性.系统聚类分析结果表明,在相似系数0.688 1处,可将64份菠萝蜜种质资源分成二天类群,在相似系数0.732 5处,第二大类群又可分为4个亚群.[结论]EST-SSR标记的多态性揭示能力强,用于分析菠萝蜜种质遗传多态性的能力强,其应用前景广阔.

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来源
《安徽农业科学》 |2016年第11期|135-139|共5页
作者
顾洪涛; 李映志; 叶春海; 陈亮;
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作者单位

广东海洋大学;

广东湛江524000;

广东海洋大学;

广东湛江524000;

广东海洋大学;

广东湛江524000;

广东海洋大学;

广东湛江524000;

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正文语种 chi
中图分类品种与种质资源（品种资源）;
关键词
菠萝蜜; EST-SSR; 遗传多样性; 种质资源;

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