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陕西等地区豆科植物根瘤内生细菌遗传多样性和系统发育研究

         
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采用16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA全序列分析、BOX-PCR等多相分类技术,对采集自陕西神木、甘肃天水、青海泽库地区的豆科植物根瘤内生细菌资源的多样性进行了研究.从采集的豆科植物根瘤中共分离到50株供试菌株,对这50株供试菌株和8株参比菌株进行了16S rDNA PCR-RFLP聚类分析.结果显示,全部供试菌株在81.5％的相似性水平上分成4个分支(在86％相似性水平上,分支Ⅰ包括3个群,分支Ⅲ包括3个群).选取各群代表菌株进行16S rDNA测序,确定了50株供试菌株中,1株属于慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium),1株属于土壤杆菌属(Agrobacterium),6株属于中华根瘤菌属(Sinorhizobium),27株属于芽孢杆菌属(Bacillus),2株属于类芽孢杆菌属(Paenibacillus),其余13株则分别归属于寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、假单胞菌属(Pseudomonas)和泛菌属(Pantoea).表明16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析结果具有较好的一致性.对部分16SrDNA序列相似性达到100％的菌株进行BOX-PCR来确定是否为同一克隆.研究结果表明,陕西神木等地区豆科植物根瘤内生菌具有很丰富的遗传多样性.

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