广州桑树矮缩病植原体secE基因序列分析与蛋白结构预测

胡小华; 张丽君; 罗焕亮; 张毅

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广州桑树矮缩病植原体secE基因序列分析与蛋白结构预测

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[目的]预测广州桑树矮缩病植原体secE蛋白的抗原性.[方法]应用PCR技术从典型矮缩症状的桑树植株总DNA中扩增到约400 bp的特异片段,将此片段克隆后与GeneBank中已报道的5种植原体的secE基因进行序列同源性分析,并对克隆基因所编码的蛋白进行理化性质、二级结构、跨膜区以及前导信号序列分析.[结果]该片段长411 bp,编码136个氨基酸的蛋白.桑树矮缩植原体与洋葱黄化植原体同源性最高,核苷酸和编码的氨基酸序列同源率分别为100%和99%.secE蛋白理化性质预测其理论等电点为9.33;二级结构主要为螺旋,其次为折叠和无规则卷曲,无转角;有3个明显的疏水区,易形成跨膜螺旋;有4个明显的抗原区域.[结论]该secE蛋白具有良好的抗原性.

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来源
《安徽农业科学》 |2011年第4期|1980-19832004|共5页
作者
胡小华; 张丽君; 罗焕亮; 张毅;
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作者单位

华南理工大学生物科学与工程学院;

广东广州;

510006;

深圳职业技术学院化生院;

广东深圳;

518055;

深圳职业技术学院化生院;

广东深圳;

518055;

深圳出入境检验检疫局;

广东深圳;

518045;

华南理工大学生物科学与工程学院;

广东广州;

510006;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类其他;
关键词
广州桑树矮缩病; 植原体; SecE基因; 同源性; 蛋白结构;

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