基于GenBank数据对红柴胡nrDNA序列ITS2片段的分析

王鹤; 杨娜; 徐丹丹; 孙明阳; 郭宏莉; 关鑫; 王世聪; 王长宝

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基于GenBank数据对红柴胡nrDNA序列ITS2片段的分析

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[目的]了解红柴胡nrDNA序列ITS2片段特征,为中药柴胡的分子鉴定提供科学依据.[方法]从GenBank中获取已公布红柴胡ITS全长序列38条和ITS2序列3条,利用MEGA6.0进行多序列比对,分析ITS2片段碱基成分、变异位点、信息位点,计算遗传距离,并用邻接法(NJ)构建系统聚类树.[结果]ITS2片段长度为224～230 bp,共发现14个简约信息位点,最大遗传距离0.124,系统树可明显分为4组,85.37％的聚为一组.[结论]ITS2在红柴胡居群中比较保守,可作为DNA barcoding鉴定的片段使用.

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来源
《安徽农业科学》|2019年第4期|114-116|共3页
作者
王鹤; 杨娜; 徐丹丹; 孙明阳; 郭宏莉; 关鑫; 王世聪; 王长宝;
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作者单位

佳木斯大学理学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

佳木斯大学生命科学学院,黑龙江佳木斯154007;

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正文语种 chi
中图分类农业生物工程;
关键词
红柴胡; ITS2; 遗传距离; 发育分析;

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