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维氏气单胞菌感染异育银鲫基因表达谱分析

         
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[目的]探讨异育银鲫在维氏气单胞菌感染的条件下肾脏组织基因表达谱.[方法]运用RNA-sequencing技术分析健康和感染维氏气单胞菌的异育银鲫肾脏组织中mRNA表达水平的变化.[结果]通过比较维氏气单胞菌感染组与健康对照组异育银鲫肾脏组织基因表达的差异,发现维氏气单胞菌感染后11567个基因表达水平发生了显著变化,其中5634个基因表达水平发生上调,5933个基因表达水平发生下调.对所有差异表达基因(DEGs)进行功能注释(GO)分析,发现1325个DEGs含有GO注释,其中上调和下调表达基因分别为581和744个;GO注释结果显示,上调表达基因主要富集于RNA指导的DNA聚合酶活性、Ⅱ型特异性脱氧核糖核酸酶活性、内切酶活性等;下调表达基因主要富集于吡哆醛结合、肽酶抑制剂活性和RNA指导的DNA聚合酶活性等.对所有DEGs进行KEGG通路分析,发现545个DEGs(215个上调表达基因,330个下调表达基因)含有KEGG注释;上调表达基因主要富集于内质网中的蛋白质加工、抗原加工和呈现和雌激素信号通路等KEGG通路;下调表达基因富集通路主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞黏附分子和jak-STAT信号通路等KEGG通路.对差异表达基因进行荧光定量PCR验证,发现其与RNA-sequencing结果具有相似的表达趋势.[结论]这些研究结果可为后续解析异育银鲫对A.veronii感染的发病机制提供参考数据.

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