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槐猪与杜洛克猪背部皮下脂肪转录组分析

         

摘要

[目的]了解槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织脂肪沉积的分子机制差异.[方法]对槐猪和杜洛克猪背部皮下脂肪组织进行转录组测序,并进行生物信息学分析.[结果]槐猪和杜洛克猪分别获得37858968和37545394条干净读段(clean reads).槐猪和杜洛克猪分别预测到9612和9457可变剪接事件;两猪种间共有709个差异表达基因,与杜洛克猪相比,槐猪有395个上调基因和314个下调基因.差异表达基因共归类到46个GO条目中,其中细胞组分11个、分子功能12个及生物学过程23个;显著富集的KEGG通路共计9个,其中含有与调节脂类代谢显著相关通路,如胰岛素信号通路和PPAR信号通路等.[结论]该研究可为今后研究脂肪沉积的遗传机理提供科学依据.

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