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首页> 中文期刊> 《畜牧与生物技术杂志：英文版》 >Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle

Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle

         
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摘要

Background: Beef cattle breeding programs in Brazil have placed greater emphasis on the genomic study of reproductive traits of males and females due to their economic importance. In this study, genome-wide associations were assessed for scrotal circumference at 210 d of age, scrotal circumference at 420 d of age, age at first calving, and age at second calving, in Canchim beef cattle. Data quality control was conducted resulting in 672,778 SNPs and 392 animals.Results: Associated SNPs were observed for scrotal circumference at 420 d of age(435 SNPs), followed by scrotal circumference at 210 d of age(12 SNPs), age at first calving(six SNPs), and age at second calving(four SNPs). We investigated whether significant SNPs were within genic or surrounding regions. Biological processes of genes were associated with immune system, multicellular organismal process, response to stimulus, apoptotic process, cellular component organization or biogenesis, biological adhesion, and reproduction.Conclusions: Few associations were observed for scrotal circumference at 210 d of age, age at first calving, and age at second calving, reinforcing their polygenic inheritance and the complexity of understanding the genetic architecture of reproductive traits. Finding many associations for scrotal circumference at 420 d of age in various regions of the Canchim genome also reveals the difficulty of targeting specific candidate genes that could act on fertility; nonetheless,the high linkage disequilibrium between loci herein estimated could aid to overcome this issue. Therefore, al relevant information about genomic regions influencing reproductive traits may contribute to target candidate genes for further investigation of causal mutations and aid in future genomic studies in Canchim cattle to improve the breeding program.

著录项

  • 来源
    《畜牧与生物技术杂志：英文版》 |2018年第001期|P.59-68|共10页
  • 作者

    Marcos Eli Buzanskas; Daniela do Amaral Grossi; Ricardo Vieira Ventura; Flavio Schramm Schenkel; Tatiane Cristina Seleguim Chud; Nedenia Bonvino Stafuzza; Luciana Diniz Rola; Sarah Laguna Concei??o Meirelles; Fabiana Barichello Mokry; Maurício de Alvarenga Mudadu; Roberto Hiroshi Higa; Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva; Maurício Mello de Alencar; Luciana Correia de Almeida Regitano; Danísio Prado Munari;

  • 作者单位

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

    Departamento de Zootecnia,Universidade Federal da Paraíba(UFPB);

    Fast Genetics,Saskatoon;

    Beef Improvement Opportunities(BIO);

    Department of Animal and Poultry Science,University of Guelph,Centre for Genetic Improvement of Livestock(CGIL);

    Departamento de Ciências Exatas,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Departamento de Zootecnia,Núcleo de Pesquisa e Conserva??o de Cervídeos,Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias,Universidade Estadual Paulista(Unesp);

    Department of Animal Science,Federal University of Lavras(UFLA);

    Department of Genetics and Evolution,Federal University of S?o Carlos(UFSCar);

    Embrapa Agricultural Informatics;

    Embrapa Dairy Cattle;

    Embrapa Southeast Livestock;

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  • 中图分类 牛;
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