玉米自交系B73铵转运蛋白基因家族分析

李红梅; 韩国民

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玉米自交系B73铵转运蛋白基因家族分析

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以玉米自交系B73全基因组数据为研究材料,运用生物信息学的方法对玉米(Zea mays)AMT基因的数量及特征进行分析.先确定AMT候选基因及其蛋白信息并定位其染色体信息,再通过对其外显子、内含子差异的对比及保守基序motif的分析,得出其系统进化树和电子表达分析.可知玉米B73中共有8个可能的AMT基因,这些基因在染色体上分布不均匀,其中ZmAMT-2,ZmAMT-5和ZmAMT-8均不含内含子,其余5个基因均含有1～2个内含子;ZmAMT基因家族预测的保守motif共有6个,均含有motif 1,2,3,4,5,8,两类基因各自的保守基序数目和位置基本相似;8个AMT基因均在叶子中表达,其中ZmAMT-2,ZmAMT-4,ZmAMT-6和ZmAMT-8在玉米的根中表达,说明这4个基因在玉米根的铵离子吸收过程中可能发挥着重要的作用.

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来源
《安庆师范学院学报（自然科学版）》 |2018年第1期|73-77|共5页
作者
李红梅; 韩国民;
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作者单位

安徽新华学院信息工程学院,安徽合肥230088;

安徽农业大学生命科学学院,安徽合肥230088;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类双子叶植物纲;
关键词
玉米; 全基因组; 铵转运蛋白; 基因预测; 特征分析;

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