肌营养不良小鼠关键基因和通路的生物信息学分析

廖子钰; 李欢; 王倞; 林金福; 张成

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肌营养不良小鼠关键基因和通路的生物信息学分析

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摘要

目的对杜兴型肌营养不良症动物模型mdx鼠的关键基因和通路进行分析,探索mdx鼠的发病机制,为DMD的潜在治疗靶点研究奠定基础.方法从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中筛选纳入GSE7187、GSE64418和GSE52766数据集,分别筛选出3个数据集中的mdx鼠的差异表达基因(differentially ex-pressed genes,DEGs),对3个数据集中重合的DEGs进行基因本体论分析、富集信号通路分析和蛋白质网络互作分析并筛选出10个网络重要节点作为关键基因.结果 3个数据集共同的DEGs有68个,其中61个基因表达上调,7个基因表达下调.GO分析发现DEGs主要与免疫系统过程有关,KEGG分析发现DEGs参与了与炎症反应和免疫反应相关的通路.Tyrobq、Emr1、C1qb、Ly86、C1qc、C1qa、Lyz2、Ms4a6d、Fcer1g和Fcgr3是mdx鼠的关键基因.结论 mdx鼠发病与免疫反应和炎症反应有关,本研究筛选出的关键基因提示了DMD新的治疗靶点.

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来源
《中风与神经疾病杂志》 |2021年第6期|496-500|共5页
作者
廖子钰; 李欢; 王倞; 林金福; 张成;
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作者单位

中山大学附属第一医院神经科广东省重大神经疾病诊治研究重点实验室国家临床重点专科和国家重点学科广东广州510030;

中山大学附属第一医院神经科广东省重大神经疾病诊治研究重点实验室国家临床重点专科和国家重点学科广东广州510030;

中山大学附属第一医院神经科广东省重大神经疾病诊治研究重点实验室国家临床重点专科和国家重点学科广东广州510030;

中山大学附属第一医院神经科广东省重大神经疾病诊治研究重点实验室国家临床重点专科和国家重点学科广东广州510030;

中山大学附属第一医院神经科广东省重大神经疾病诊治研究重点实验室国家临床重点专科和国家重点学科广东广州510030;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类中耳疾病;
关键词
杜兴型肌营养不良症; mdx鼠; 关键基因; 信号通路; 生物信息学;

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