超速离心结合Real-time PCR分离纯化枣疯病植原体DNA

陈昱圻; 郝少东; 王合; 陶万强; 张志勇; 王进忠

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分离纯化枣疯病植原体基因组DNA,有助于进一步开展对此病原全基因组测序的研究,CTAB法提取枣疯病叶片的总DNA后,采用氯化铯双苯酰亚胺密度梯度离心法从枣树总DNA中富集纯化枣疯病植原体DNA,并通过Real-time PCR方法对分离纯化效果进行定量检测.在此基础上,探索了不同CsCl初始密度对DNA分离效果的影响.在20℃,初始密度为1.650 0 g/cm3,经206 000×g下离心23 h后,感染枣疯病样品(IS)的离心管中出现2条DNA亮带,正常枣树样品(NS)离心管中只有1条.Real-time PCR检测结果表明NS管中的条带为枣树基因组DNA;IS管中与NS管中相同位置的条带为枣树基因组DNA,另1条带为枣疯病植原体基因组DNA.在保留其他试验条件下,不同CsCl初始密度,会影响DNA条带的位置,也会影响枣疯病植原体DNA与枣树DNA的分离效果,在1.562 2 g/cm3的初始浓度下分离效果最好.采用超速离心法可以有效地从感染枣疯病的枣树中分离得到纯的枣疯病植原体DNA,同时利用Real-time PCR法可以实现分离效果的评价,利用此方法分离得到的DNA可用于枣疯病植原体的全基因组测序.

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来源
《北京农学院学报》 |2015年第2期|5-9|共5页
作者
陈昱圻; 郝少东; 王合; 陶万强; 张志勇; 王进忠;
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作者单位

农业应用新技术北京市重点实验室,北京农学院植物科学技术学院,北京102206;

农业应用新技术北京市重点实验室,北京农学院植物科学技术学院,北京102206;

北京市林业保护站,北京100029;

北京市林业保护站,北京100029;

农业应用新技术北京市重点实验室,北京农学院植物科学技术学院,北京102206;

农业应用新技术北京市重点实验室,北京农学院植物科学技术学院,北京102206;

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正文语种 chi
中图分类 Q945.8;
关键词
枣疯病植原体DNA; 氯化铯双苯酰亚胺密度梯度离心法; 实时荧光定量PCR;

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