不同光照强度胁迫下的多型杜氏藻转录组分析

高帆; 杨鹏; 王飞; 徐璐; 汤丽群

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不同光照强度胁迫下的多型杜氏藻转录组分析

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为研究多型杜氏藻在光照胁迫下的应答机制,筛选差异表达基因,分析其功能及参与的代谢通路,以成熟期的多型杜氏藻为研究对象,分别设置遮光对照组、中光强胁迫组和高光强胁迫组,用形态学、荧光参数测定、高通量测序及生物信息学方法分别对其进行细胞、生化及转录组水平的分析。结果显示,光强的升高有利于藻细胞的形态发育与叶绿素合成,中光胁迫组的光合效率高于高光胁迫组和遮光组。9个RNA测序文库中共获得52853条unigenes,其中coding domain sequence(CDS)29025条,41.59%可被7个生物数据库注释,de novo组装了282条contigs,其中N50为1072 bp,GC百分比52.25%。基于基因的差异表达,中光强胁迫组与高光强胁迫组可聚为一簇,下调基因数量(9385)高于上调基因数量(8046)。组间的共有差异基因GO及KEGG通路分析表明,多型杜氏藻光胁迫应答过程中相关基因功能主要与胞内的光合作用催化活性及天线蛋白合成有关,参与的代谢通路主要与光刺激下的新陈代谢过程有关。研究结果为该藻光合机理的深入研究,光合调控关键基因的克隆与表达、特色资源分子选育及其工业应用奠定基础。

著录项

来源
《生物学杂志》 |2022年第6期|77-83|共7页
作者
高帆; 杨鹏; 王飞; 徐璐; 汤丽群;
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作者单位

山西大学生命科学学院;

山西大学教务处;

山西大学生物技术研究所;

山西大学体育学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类植物细胞遗传学;
关键词
多型杜氏藻; 转录组测序; 光照强度; 差异表达基因;

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