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一种用于蛋白质检索的运用混合谱特征的形状描述符

         

摘要

蛋白质的不同构像及结构变化使得传统的形状描述算法在蛋白质数据集上的检索效果并不理想。为了提高检索性能,提出了一种新的基于混合谱特征的蛋白质形状描述符及蛋白质检索框架,该方法结合了Wave Kernel Signature和Heat Kernel Signature产生新的Bag of Feature,即WKS_HKS算法。对WKS_HKS算法和现有的几种形状描述算法在三个不同类型的分子数据集上进行了综合比较。实验结果表明,该算法比单一的算法的检索效果更好,并优于几种对比的形状描述算法。

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