甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸-甘氨酸四肽气相稳定构型的系统寻找

陈惠宾; 王耀; 陈欣; 林子敬

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甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸-甘氨酸四肽气相稳定构型的系统寻找

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cqvip:利用PM3、HF和BHandHLYP方法的结合，系统寻找了甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸-甘氨酸（GFGG）四肽存气相中的稳定构型．对该构型寻找方法进行了详细的描述，并给出了一些重要构型的基本参数，如电子能、零点振动能、偶极矩、转动常数、垂直电离能和不同温度的构型分布等．通过财重要构型结构特征的分析，发现熵的效应是决定构型稳定性的重要因素，并讨论指出了对构型偶极矩和特征振动模的测量是验证理论预言的有效途径．对GFGG构型与蛋白质二级结构的联系的分析表明，GFGG低能构型出现了类似于α-螺旋的局域结构，以及数量可观的蛋白质β转角和γ转角的局域结构．

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来源
《化学物理学报》 |2012年第1期|P.77-85I0004|共10页
作者
陈惠宾; 王耀; 陈欣; 林子敬;
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作者单位

中国科学技术大学微尺度物质科学国家实验室合肥230026;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类数理科学和化学;
关键词
势能面; 构型稳定性; 氧键; 熵效应; 二级结构;

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