EST-SSR构建益母草栽培种指纹图谱及遗传多样性

王丹丹; 王鹏

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为了对益母草品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,试验采用EST-SSR(Expressed Sequence Tag-Simple Sequence Repeats)分子标记技术构建了生产上常用的10个益母草栽培品种的数字指纹图谱及遗传多样性分析。试验共筛选出13对益母草EST-SSR分子标记,检测等位位点61个,其中含多态性位点52个,多态性比率为85.2%。EST-SSR引物扩增2~11个等位位点,平均每对引物扩增4.69个基因型,扩增条带100~600 bp,多态信息含量(PIC)0.551,基因流(Nm)1.319,平均杂合率0.647。从13对引物中,筛选出5对核心引物,即LJ17、LJ21、LJ29、LJ47和LJ62,以引物组合方式构建指纹图谱可区分10个品种;聚类分析表明在遗传距离0.66处10个品种被分为3类,聚类结果与品种的来源具有较高的一致性。

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来源
《辽东学院学报：自然科学版》 |2020年第3期|165-170|共6页
作者
王丹丹; 王鹏;
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作者单位

辽东学院农学院;

辽宁丹东118003;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 Q663;
关键词
益母草; EST-SSR标记; 指纹图谱; 遗传多样性; 聚类分析;

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