石柱参SzPLC1基因的生物信息学分析及胁迫应答

王丹丹; 齐彤彤

首页> 中文期刊> 《辽东学院学报：自然科学版》 >石柱参SzPLC1基因的生物信息学分析及胁迫应答

石柱参SzPLC1基因的生物信息学分析及胁迫应答

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

利用RT-PCR结合RACE技术,克隆石柱参磷脂酶C(SzPLC1)基因,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行数据分析,同时探讨干旱胁迫对SzPLC1表达的影响。结果显示:该基因全长1725 bp,开放阅读框(ORF)长度为1455 bp,编码484个氨基酸,分子质量为54.8 ku,具有2个跨膜结构域X和Y区;SzPLC1蛋白二级结构包括无规则卷曲(40.91%)、α-螺旋(37.54%)、延伸链(18.39%)和β-转角(4.96%)。系统进化分析表明石柱参SzPLC1蛋白与萝卜(Raphanus sativus,XP_018480211.1)的RsPLC1蛋白表现出较高的同源性(95%)。String蛋白互作网络分析表明,与SzPLC1蛋白互作的蛋白质共有10个,均为磷脂酰肌醇信号通路的重要酶类,说明SzPLC1是磷脂酰肌醇信号通路中关键的酶。qRT-PCR分析表明,在干旱处理下,SzPLC1的表达量明显上调,说明SzPLC1蛋白具有抗干旱胁迫的功能。

著录项

来源
《辽东学院学报：自然科学版》 |2021年第4期|234-242|共9页
作者
王丹丹; 齐彤彤;
展开▼
作者单位

辽东学院农学院;

辽宁丹东118003;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类基因的表达;
关键词
石柱参; 磷脂酶C; SzPLC1; 克隆; 胁迫应答;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 小黑杨MYB32基因生物信息学及应答盐胁迫分析 [J] . 顾咏梅 ,夏鑫慧 ,王宇婷 . 山西农业大学学报（自然科学版） . 2021,第006期
2. 杨树HSF家族基因生物信息学与胁迫应答表达分析 [J] . 王雪怡 ,顾咏梅 ,张雪梅 . 北京林业大学学报 . 2021,第2期
3. 白桦HD-Zip基因家族生物信息学及应答盐胁迫分析 [J] . 王家啟 ,张曦 ,李莉 . 植物研究 . 2018,第6期
4. 盐胁迫应答基因Ossos5的生物信息学分析 [J] . 杨献光 ,张榜军 ,刘青兰 . 河南师范大学学报：自然科学版 . 2009,第6期
5. 小黑杨HD-Zip转录因子家族生物信息学及应答盐胁迫分析 [J] . 张雪梅 ,姚文静 ,赵凯 . 植物研究 . 2017,第5期
6. 马铃薯应答低温胁迫ALDH2基因的筛选分离 [C] . 胡妍 ,韦秋燕 ,刘乐乐 . 2021年中国马铃薯大会 . 2021
7. 竹节参的分子鉴定及其β-香树脂醇合成酶基因克隆、生物信息学分析 [A] . 许成 . 2017

石柱参SzPLC1基因的生物信息学分析及胁迫应答

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅