基于纳米孔测序技术的柑橘黄龙病检测方法建立

卢慧林; 陈大嵩; 陈逢浩; 叶静文; 欧阳革成

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基于纳米孔测序技术的柑橘黄龙病检测方法建立

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柑橘黄龙病(Huanglongbing)是柑橘生产上最具毁灭性的病害,及时快速地进行早期检测和诊断是防控黄龙病的关键措施之一.本文利用掌上纳米孔测序仪MinION对携带黄龙病菌Candidatus Liberibacter asiaticus的DNA样品进行测序,并利用Blast、GraphMap、minimap2以及两种bwa的比对方法将测序结果比对到黄龙病菌基因组上,比对结果均匀的比对到黄龙病菌基因组上,并未发现严重的偏倚现象,验证了其测序结果的可靠性.本技术可弥补因柑橘木虱Diaphorina citri(Kuwayama)虫体过小或损坏难以进行光学识别的不足,并可同时检测虫体是否携带有黄龙病菌,对有黄龙病发生风险但尚未有黄龙病实际发生的柑橘种植区提供实时实地的监控与预警.

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来源
《环境昆虫学报》 |2021年第6期|1596-1600|共5页
作者
卢慧林; 陈大嵩; 陈逢浩; 叶静文; 欧阳革成;
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作者单位

广东省科学院动物研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室广州510260;

广东省科学院动物研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室广州510260;

广东省科学院动物研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室广州510260;

华南农业大学植物保护学院广州510642;

广东省科学院动物研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室广州510260;

广东省科学院动物研究所广东省动物保护与资源利用重点实验室广东省野生动物保护与利用公共实验室广州510260;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类昆虫生态学;植物虫害及其防治;
关键词
柑橘黄龙病; MinION; 测序; 快速诊断;

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