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健康和患病凡纳滨对虾幼虾消化道菌群结构的比较

         

摘要

凡纳滨对虾养殖过程中,早期阶段是病害易感阶段,而消化道菌群结构与对虾健康关系密切.因此,探讨幼虾的消化道菌群尤其是弧菌类细菌与对虾发病的关系对病害有效防治具有重要意义.本实验采用Illumina测序研究了凡纳滨对虾健康和患病幼虾的消化道细菌群落结构,并基于纯培养和16S rDNA,recA和pyrH基因序列比对,分析了幼虾消化道中弧菌的主要种类组成.结果发现,健康幼虾消化道中洳变形菌纲和厚壁菌门丰度较高,而患病幼虾中γ-变形菌纲、拟杆菌门、放线菌门和β-变形菌纲较高,其中放线菌门丰度差异显著.基于科水平的响应比分析,发现患病幼虾消化道中动性球菌科和噬菌弧菌科的丰度显著降低,而弧菌科的丰度显著升高.相似度分析发现,驱动群落变异的OTU主要来源于弧菌属、海洋杆状菌属、冷杆菌属、假交替单胞菌属以及未分类至属的红杆菌科和微杆菌科.健康幼虾消化道弧菌组成以锡那罗亚州弧菌为主,而患病幼虾消化道弧菌组成以坎氏弧菌为主.尽管健康和患病幼虾消化道内细菌群落结构整体差异不显著,但一些重要类群丰度变化显著,其特征与已知的生态功能一致.

著录项

  • 来源
    《水产学报》 |2016年第11期|1765-1773|共9页
  • 作者单位

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    宁波大学医学院,浙江宁波315211;

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    浙江海洋高效健康养殖协同创新中心,浙江宁波315211;

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    宁波市鄞州瞻岐椿霖养殖场,浙江宁波315145;

    宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211;

    浙江海洋高效健康养殖协同创新中心,浙江宁波315211;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 甲壳类养殖;
  • 关键词

    凡纳滨对虾; 消化道菌群; Illumina测序; 弧菌; 病害;

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