8种鲤养殖品种线粒体Cyt b基因的遗传多样性和系统进化分析

肖同乾; 鲁翠云; 李超; 张明昭; 顾颖; 孙效文

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8种鲤养殖品种线粒体Cyt b基因的遗传多样性和系统进化分析

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对8种鲤养殖品种的线粒体Cyt b基因部分序列进行测定,并比较分析其遗传多样性和系统进化关系,结果获得425 bp的Cyt b序列,其中T、C、A、G的平均含量分别为26.8％、29.0％、29.7％、14.5％,A+T含量(56.5％)高于G+C含量(43.5％),翻译为141个氨基酸,其中突变多数存在于缬氨酸和异亮氨酸之间(两个氨基酸都为不带电荷的疏水性氨基酸),其变异不影响Cyt b的功能,说明该蛋白是一个进化缓慢的蛋白,适合用于遗传进化分析.140个个体中共检测到4个单倍型,其中75.5％的个体属于单倍型Hap 2,而单倍型Hap1主要分布在3种表现型为镜鲤的品种.AMOVA分析结果和利用Kimura 2-parameter模型分析的系统发育关系结果表明,德国镜鲤、散磷镜鲤和松浦红镜鲤亲缘关系较近,而蓝鳞鲤、荷包红鲤抗寒品系和高寒鲤亲缘关系较近.

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来源
《水产学报》 |2013年第3期|344-350|共7页
作者
肖同乾; 鲁翠云; 李超; 张明昭; 顾颖; 孙效文;
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作者单位

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;

大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连 116023;

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;

上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;

中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江哈尔滨150070;

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正文语种 chi
中图分类细胞器遗传;水产动物学;
关键词
鲤; 遗传多样性; 细胞色素b;

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