黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学

钟婵; 吴国平; 舒梅; 孙乐常; 曹敏杰

首页> 中文期刊> 《水产学报》 >黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学

黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

研究表明弹性蛋白酶（elastase, Ela）参与调控嗜水气单胞菌引起的细菌性溃疡病,对控制鱼类养殖中免疫疾病有重要作用。本研究根据已报道脊椎动物的Elas基因序列设计特异性引物,通过RT-PCR和RACE技术克隆获得黄鳍鲷Ela基因（AlEla）cDNA序列全长,并对其进行生物信息学分析。结果显示,AlEla基因全长为946 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码269个氨基酸,含有16个氨基酸信号肽的亲水性稳定膜外蛋白,定位于细胞外基质,具有3个O-糖基化和15个磷酸化的潜在位点。编码的成熟AlEla蛋白预测相对分子质量27 509 u,等电点为6.05。氨基酸序列同源性比对发现,AlEla与鲷和鲆的Elas2的同源性为84.76%～99.26%,处于系统进化树上同一分支,表明它们的亲缘性相近。AlEla具有Elas的保守结构,如Tryp-SPc结构域、丝氨酸蛋白酶催化三联体、保守的半胱氨酸残基以及在C端含有GDSGGPL序列等,揭示该酶有丝氨酸蛋白酶的催化活性。对AlEla蛋白的二级结构分析显示,α-螺旋、β-转角、β-折叠和无规则卷曲所占的比例分别为17.84%、7.06%、24.54%和50.56%。三级结构分析推测α-螺旋和β-折叠对于AlEla蛋白的空间构象可能有着重要作用。本研究从黄鳍鲷肌肉中成功克隆AlEla基因并分析其生物信息学特征,为后续研究AlEla参与调控鱼类免疫疾病的机制提供理论基础。

著录项

来源
《水产学报》 |2021年第1期|125-135|共11页
作者
钟婵; 吴国平; 舒梅; 孙乐常; 曹敏杰;
展开▼
作者单位

1. 江西农业大学食品科学与工程学院 2. 集美大学食品与生物工程学院;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类水产动物学;
关键词
黄鳍鲷; 弹性蛋白酶; 基因克隆; 生物信息学分析;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 气肿疽梭菌CctA全长基因的克隆及生物信息学分析 [J] . 陈晓洁 ,李新苹 ,何高明 . 甘肃畜牧兽医 . 2020,第002期
2. 金花茶异戊烯焦磷酸异构酶基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析 [J] . 王辉 ,叶晓霞 ,朱宇林 . 中南林业科技大学学报 . 2019,第009期
3. 印度谷螟PintGOBP2基因的全长序列克隆及其生物信息学分析 [J] . 李慧 ,王殿轩 . 粮油食品科技 . 2019,第005期
4. 白及GMP基因cDNA全长克隆及生物信息学分析 [J] . 许娟 ,石云平 ,韦绍龙 . 西南农业学报 . 2018,第006期
5. 急性单核细胞白血病相关抗原基因MLAA-22全长的克隆及生物信息学分析 [J] . GU Liufang ,ZHANG Pengyu ,CAO Xingmei . 实用癌症杂志 . 2018,第012期
6. 家蚕耐氟近等基因系SSH文库中碱性丝氨酸蛋白酶基因全长cDNA的克隆与表达特征分析 [C] . 张华光 ,吴萍 ,刘娟 . 江苏省昆虫学会第十三次会员代表大会暨学术研讨会 . 2012
7. 草鱼unc45b基因的全长克隆、生物信息学分析及投喂蚕豆对该基因表达的影响 [A] . 胡静 . 2016

黄鳍鲷肌肉中弹性蛋白酶基因全长克隆及生物信息学

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅