剑尾鱼肝脏cDNA文库的构建

刘坡; 李凯彬; 王芳; 刘春; 聂湘平; 吴淑勤

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剑尾鱼肝脏cDNA文库的构建

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以暴露于β-萘黄酮(beta-Naphthoflavone,β-NF)中的剑尾鱼(Xiphophorus helleri)为研究对象,采用SMARTTM(SwitchingMechanism At 5,end of RNA Transcript)技术,成功构建了剑尾鱼肝脏cDNA文库.该文库约含有4.2×107个重组子,重组效率达100%,插入片段多在0.6～2.5 kb之间,平均插入片段长度约1.3 kb,扩增后文库滴度为7.0×109 CFU/mL.随机挑取200个重组子进行测序检验,共得到长度大于500 bp的Expression sequence tag(EST)序列187个,对所测EST序列进行拼接,得到16个重叠群(Contigs),81个单拷贝EST,总计单基因簇97个.结果表明,剑尾鱼肝脏的全长cDNA文库已构建成功,且质量较高,从而为筛选剑尾鱼肝脏的功能基因全长序列奠定了基础.

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来源
《中国水产科学》 |2009年第4期|487-495|共9页
作者
刘坡; 李凯彬; 王芳; 刘春; 聂湘平; 吴淑勤;
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作者单位

广东海洋大学,广东,湛江,524088;

中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东,广州,510380;

中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东,广州,510380;

中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东,广州,510380;

中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东,广州,510380;

暨南大学水生生物研究所,广东,广州,510630;

中国水产科学研究院珠江水产研究所,广东,广州,510380;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类动物分类学（系统动物学）;
关键词
剑尾鱼; 肝脏; cDNA文库;

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