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暗纹东方鲀线粒体DNA控制区结构和系统发育分析

         
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摘要

以暗纹东方鲀(Takifugufasciatus)肝脏线粒体DNA为模板,参照GenBank中红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)线粒体DNA序列设计合成特异引物进行PCR扩增,获得了暗纹东方鲀线粒体DNA控制区基因(818 bp)及5'端上游的tRNAPro基因(71 bp)的全序列.控制区碱基组成为T 32.2%,C 19.1%,A 35.6%,G13.2%.对照其他已报道的鱼类控制区结构,对暗纹东方鲀控制区的结构进行了分析,识别了其终止序列区、中央保守区和保守序列区,找到了终止相关的序列TAS以及保守序列(CSB1,CSB2,CSB3).CSB1、GSB2序列相对保守,TAS与其回文基序可形成稳定的茎环结构,成为H-链复制延伸时的终止识别位点.同时运用DNA分析软件对暗纹东方鲀与GenBank中其他10多种鱼类的mtDNA控制区序列进行比对,并选取东方鲀属的7种鱼类mtDNA控制区序列构建分子系统树.结果显示控制区基因较适于鲀科鱼类中同属不同种的系统发育分析.

著录项

  • 来源
    《中国水产科学》 |2007年第3期|352-360|共9页
  • 作者

    邵爱华; 朱江; 史全良; 陈葵;

  • 作者单位

    苏州大学,生命科学学院,江苏,苏州,215123;

    苏州科技学院,生物系,江苏,苏州,215009;

    苏州大学,生命科学学院,江苏,苏州,215123;

    苏州大学,生命科学学院,江苏,苏州,215123;

    苏州大学,生命科学学院,江苏,苏州,215123;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 Q959.468;
  • 关键词

    暗纹东方鲀; mtDNA控制区; 系统关系;

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