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人体脑组织RNA表达水平与早期PMI的相关性

         

摘要

目的 探讨人体脑组织多种RNA指标的表达水平与早期死亡时间(PMI)的相关性. 方法 选取12例已知PMI (4.3~22.5 h)的个体,提取脑组织总RNA.选取8种常用RNA指标(β-actin、GAPDH、RPS29、18S rRNA、5S rRNA、U6 snRNA、miRNA-9、miRNA-125b),通过实时荧光定量PCR技术检测其在脑组织中的表达水平.运用geNorm软件筛选早期PMI表达稳定的内参指标,并分析其表达水平与相关因素(年龄、性别、死亡原因)的关系.运用R软件将内参标准化的RNA指标代入前期研究建立的数学模型推断PMI,计算推断PMI的误差率以验证模型精确性. 结果 5S rRNA、miRNA-9和miRNA-125b表达稳定,其表达水平与年龄、性别、死亡原因无关.利用β-actin推断PMI的误差率为24.6%,GAPDH为41.0%. 结论 5S rRNA、miRNA-9和miRNA-125b在死亡早期表达稳定,适合作为人体脑组织的内参指标.β-actin表达水平与PMI相关性良好,有望成为推测早期PMI的辅助指标.

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