竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析

吴妙丽; 陈世品; 陈辉

首页> 中文期刊> 《森林与环境学报》 >竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析

竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

以3种竹亚科植物的叶绿体基因组编码基因为研究对象,分析基因的密码子偏性形成的主要因素。结果显示:3种竹子具有相似的密码子使用模式,均偏爱以A或T结尾的密码子。奇偶偏好性分析进一步证实密码子第3位T的出现频率高于A。通过中性分析发现,GC12与GC3并无显著相关性。奇偶偏好分析表明,4种碱基不成比例分布在密码子第3位上(CT>AG),说明选择压力可能起到重要作用。基于同义密码子的相对使用度(RSCU)的对应分析中,第1主向量轴仅解释了约10%的变异;3种竹子的轴2一致地与CAI呈显著负相关(P<0.05);轴4与ENC、GC3呈极显著相关(P<0.05)。综合以上结果,竹亚科叶绿体基因密码子的使用偏性是由自然选择和碱基组成共同作用形成,选择压力起主要作用。

著录项

来源
《森林与环境学报》 |2019年第1期|P.9-14|共6页
作者
吴妙丽; 陈世品; 陈辉;
展开▼
作者单位

[1]福州外语外贸学院;

福建长乐350202;

[2]福建农林大学林学院;

福建福州350002;

[2]福建农林大学林学院;

福建福州350002;

[2]福建农林大学林学院;

福建福州350002;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 CHI
中图分类植物基因工程;
关键词
竹亚科; 叶绿体基因组; 密码子使用偏性;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析 [J] . 吴妙丽 ,陈世品 ,陈辉 . 福建林学院学报 . 2019,第001期
2. 糜子叶绿体基因组密码子使用偏性的分析 [J] . 刘慧 ,王梦醒 ,岳文杰 . 植物科学学报 . 2017,第003期
3. 糜子叶绿体基因组密码子使用偏性的分析 [J] . 刘慧 ,王梦醒 ,岳文杰 . 植物科学学报 . 2017,第003期
4. 陆地棉叶绿体基因组密码子使用偏性的分析 [J] . 尚明照 ,刘方 ,华金平 . 中国农业科学 . 2011,第002期
5. 银杏叶绿体基因组密码子使用偏性分析 [J] . 李薇 ,王倩 ,胡晓艳 . 林业调查规划 . 2021,第006期
6. 贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析 [C] . LAN Qing-Kuo ,兰青阔 ,CHEN Rui . 第二届京津冀农产品质量安全青年论坛 . 2018
7. 基于RNA-seq测序技术糜子转录组分析以及糜子叶绿体基因组密码子使用模式分析 [A] . 刘慧 . 2017

竹亚科叶绿体基因组的密码子使用偏性分析

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅