泡桐丛枝病相关lncRNAs的表达和调控

李文杨; 李永生; 曹亚兵; 王哲; 闫丽君; 范国强

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泡桐丛枝病相关lncRNAs的表达和调控

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为揭示与泡桐丛枝病相关的长链非编码RNA(lncRNA),探讨其调控模式,利用高通量测序平台Illumina HiseqTM2000对泡桐的健康苗、丛枝病苗和利福平处理的丛枝病苗进行测序,筛选出差异表达的lncRNAs和靶基因,并对靶基因进行基因本体论(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集性分析.结果表明:共鉴定出的3237个候选lncRNAs,其中PT/PTI、PT/PTIL-100和PTI/PTIL-100中差异表达并且相同的lncRNAs有147个,靶基因富集于40个GO和119条代谢通路.通过比较分析,发现72个lncRNAs可能与泡桐丛枝病发生相关,其靶基因主要参与的KEGG代谢途径有磷脂酶D信号通路、Wnt信号通路、ABC转运、糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚定生物合成途径、次生代谢产物的生物合成、泛素介导的蛋白水解、玉米素生物合成、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢等.预测lncRNAs(TCONS_00009507、TCONS_00019521、TCONS_00012917、TCONS_00030963和TCONS_0002705)调控靶基因参与泡桐丛枝植原体与泡桐互作和影响细胞周期改变泡桐形态建成,为泡桐丛枝病发生机理的研究奠定基础.

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来源
《福建林学院学报》 |2019年第2期|181-187|共7页
作者
李文杨; 李永生; 曹亚兵; 王哲; 闫丽君; 范国强;
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作者单位

信阳农林学院林学院,河南信阳464000;

河南农业大学泡桐研究所,河南郑州450002;

河南农业大学泡桐研究所,河南郑州450002;

河南农业大学泡桐研究所,河南郑州450002;

河南农业大学泡桐研究所,河南郑州450002;

河南农业大学泡桐研究所,河南郑州450002;

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正文语种 chi
中图分类侵染性病害;
关键词
泡桐; 丛枝病; 植原体; 长链非编码RNA;

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